Δημοσιεύσεις

Δημοσιεύσεις και ανοιχτά δεδομένα

Οι μελέτες πίσω από το ClinicalMiner και τη μηχανή ανωνυμοποίησής του, και τα δεδομένα στα οποία στηρίζονται. Τα δεδομένα δημοσιεύονται ανοιχτά, ώστε ο καθένας να μπορεί να ελέγξει τα αποτελέσματα ή να δοκιμάσει το δικό του σύστημα στο ίδιο υλικό.

Σύνολα δεδομένων

Σύνολο δεδομένων · 2026 · Έκδοση 1.0.0

Greek Clinical De-identification Benchmark: 500 synthetic discharge notes with arbitrated gold standard, scoring rules and system outputs

Filippos-Paschalis Rorris, Nikoleta Stanitsa, Tatiana Rorri, Foteini Rorri, Constantine N. Antonopoulos

  • Το πρώτο δημόσιο σημείο αναφοράς (benchmark) για την ανωνυμοποίηση ελληνικού κλινικού κειμένου.
  • 500 πλήρως συνθετικά εξιτήρια (καρδιοχειρουργική, καρδιολογία, νεφρολογία). Δεν περιέχει κανέναν πραγματικό ασθενή.
  • 7.937 στοιχεία ταυτοποίησης που πρέπει να αφαιρεθούν, επισημειωμένα από δύο ανεξάρτητους αξιολογητές και με διαιτησία.
  • 6.747 κλινικά στοιχεία που πρέπει να διατηρηθούν, ώστε να μετράται και η υπερβολική αφαίρεση, όχι μόνο οι διαρροές.
  • Περιλαμβάνει τους κανόνες και τον κώδικα βαθμολόγησης, και ρεαλιστικές αποδόσεις PDF κάθε εξιτηρίου.
Zenodo · DOI 10.5281/zenodo.22824895 GitHub Hugging Face
ΠαραπομπήRorris F-P, Stanitsa N, Rorri T, Rorri F, Antonopoulos CN. Greek Clinical De-identification Benchmark: 500 synthetic discharge notes with arbitrated gold standard, scoring rules and system outputs (version 1.0.0) [Data set]. Zenodo; 2026. https://doi.org/10.5281/zenodo.22824895

Άδεια δεδομένων CC BY 4.0· κώδικας βαθμολόγησης MIT. Το Zenodo είναι η επίσημη εγγραφή· το GitHub και το Hugging Face φέρουν την ίδια έκδοση.

Μοντέλα

Λογισμικό · 2026 · Έκδοση 6.0 · Περιορισμένη πρόσβαση

Morpheus name model 6.0 — the name detector of the Morpheus de-identification engine for Greek clinical text

Filippos-Paschalis Rorris, Foteini Rorri

  • Νευρωνικός ανιχνευτής ονομάτων (πολυγλωσσικό μοντέλο GLiNER) εκπαιδευμένος σε 7.500 συνθετικά κλινικά σημειώματα, 6.000 στα ελληνικά και 1.500 στα αγγλικά, γραμμένα γι’ αυτόν τον σκοπό μαζί με τις απαντήσεις τους. Δεν χρησιμοποιήθηκαν πραγματικά δεδομένα ασθενών.
  • Εντοπίζει ονόματα ασθενών και προσωπικού, ημερομηνίες, αριθμούς μητρώου, τηλέφωνα, διευθύνσεις, ονόματα νοσοκομείων και στοιχεία επικοινωνίας· τρέχει μέσα στην εφαρμογή σε έναν συνηθισμένο φορητό υπολογιστή.
  • Η εγγραφή είναι δημόσια και παραπέμψιμη· το ίδιο το αρχείο του μοντέλου δίνεται μόνο σε ταυτοποιημένους ερευνητές και φορείς υγείας κατόπιν αιτήματος, για έρευνα και για την ανωνυμοποίηση των δικών τους εγγράφων.
Zenodo · DOI 10.5281/zenodo.23456887 Αίτημα πρόσβασης
ΠαραπομπήRorris F-P, Rorri F. Morpheus name model 6.0 — the name detector of the Morpheus de-identification engine for Greek clinical text (a GLiNER model fine-tuned on 7,500 synthetic clinical notes) (version 6.0) [Computer software]. Zenodo; 2026. https://doi.org/10.5281/zenodo.23456887

Βασισμένο στο urchade/gliner_multi-v2.1 (Apache-2.0). Το παραπάνω DOI ονομάζει όλες τις εκδόσεις και οδηγεί πάντα στην πιο πρόσφατη· η έκδοση 6.0 είναι το 10.5281/zenodo.23456888.

Άρθρα

Προδημοσίευση · 2026 · arXiv · Υπό κρίση

Morpheus: a fully local, defense-in-depth de-identification engine for Greek clinical text — a benchmark evaluation

Filippos-Paschalis Rorris, Nikoleta Stanitsa, Tatiana Rorri, Foteini Rorri, Constantine N. Antonopoulos

arXiv · 2610.25155 PDF
ΠαραπομπήRorris F-P, Stanitsa N, Rorri T, Rorri F, Antonopoulos CN. Morpheus: a fully local, defense-in-depth de-identification engine for Greek clinical text — a benchmark evaluation [Preprint]. arXiv; 2026. https://doi.org/10.48550/arXiv.2610.25155

Προδημοσίευση: δεν έχει ακόμη περάσει από κρίση. Αξιολογεί τον Morpheus 1.0 στο παραπάνω σώμα κειμένων. Η παραπομπή του περιοδικού θα προστεθεί εδώ μόλις δημοσιευθεί το άρθρο.